JSBML是一个社区驱动的项目，旨在创建一个免费的、开源的、纯Java™库，用于读取、写入和操作SBML文件（系统生物学标记语言）和数据流。它是libSBML中提供的基于Java/原生代码的混合界面的一个替代方案。
COBRApy是一个用于基于约束的代谢网络建模的软件包。
一个可扩展和可定制的GUI API/库，用于创建ClickGUIs、HUDEditors和TabGUIs，旨在用于Minecraft实用模型。
INDRA（综合网络和动态推理组装器）是一个自动模型组装系统，与NLP系统和数据库对接，收集知识，并通过组装过程，产生因果图和动态模型。
PEtab - 一个基于SBML和TSV的数据格式，用于系统生物学中的参数估计问题
一个分享和重用生物建模研究的平台，包括模型、模拟和其结果的可视化。
一个用于可视化和编辑路径模型的网络应用程序
与CVODES和IDAS的高级多语言接口
一个JavaScript / Python / PHP加密货币交易API，支持100多个比特币/altcoin交易所
Gravitee.io - 开源API管理
欢迎来到Jakarta EE交易API项目（以前的JTA）。