生物信息学开源项目点评

dash

Python

用于Python、R、Julia和Jupyter的分析性网络应用。不需要JavaScript。

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biopython

Python

Biopython的官方git仓库(最初由CVS转换)。

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1,561
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deepvariant

Python

DeepVariant是一个分析管道,使用深度神经网络从下一代DNA测序数据中调用遗传变体。

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664
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2,675

biopandas

Python

在pandas DataFrames中处理分子结构

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104
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552

dgl-lifesci

Python

用于化学和生物学中的图形神经网络的Python软件包

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124
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DnaFeaturesViewer

Python

:眼。绘制DNA序列特征的Python库(例如来自Genbank文件)。

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69
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pronto

Python

一个通往(开放生物医学)本体的Python前端。

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39
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201

DnaChisel

Python

:pencil2。一个多功能的DNA序列优化器

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24
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indra

Python

INDRA(综合网络和动态推理组装器)是一个自动模型组装系统,与NLP系统和数据库对接,收集知识,并通过组装过程,产生因果图和动态模型。

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54
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OBOFoundry.github.io

Python

开放生物本体基金会本体登记处的元数据和网站

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pybel

Python

🌶️在Python中使用生物表达语言(BEL)的生态系统。

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PathMe

Python

使用生物表达语言(BEL)统一路径数据库

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