SBML(系统生物学标记语言)是一种基于XML的格式,用于交流和存储生物过程的表述。它的目的是成为代表生物学模型的通用语言。SBML适用于在一些课题研究中常见的模型,包括细胞信号通路、代谢通路、生化反应、基因调控和其他许多课题。
COBRApy是一个用于基于约束的代谢网络建模的软件包。