SBML(系统生物学标记语言)是一种基于XML的格式,用于交流和存储生物过程的表述。它的目的是成为代表生物学模型的通用语言。SBML适用于在一些课题研究中常见的模型,包括细胞信号通路、代谢通路、生化反应、基因调控和其他许多课题。
INDRA(综合网络和动态推理组装器)是一个自动模型组装系统,与NLP系统和数据库对接,收集知识,并通过组装过程,产生因果图和动态模型。